小孩感染甲型流感痊愈后通常不会有后遗症，但极少数患儿可能因病情严重或治疗不及时出现并发症。多数儿童在规范治疗和充分休息后可完全恢复健康，家长无需过度担忧。
甲型流感属于自限性疾病，大部分患儿在发病后5-7天症状逐渐消退，体温恢复正常，咳嗽等呼吸道症状也会在2周内逐步缓解。规范使用奥司他韦等抗病毒药物可有效缩短病程，及时退热、补液等对症处理能促进身体康复。临床数据显示，90%以上的患儿不会遗留长期健康问题。
少数重症病例可能出现心肌损伤，表现为心电图异常或心肌酶升高，这种情况需持续心内科随访。个别患儿可能继发细菌性肺炎，需根据痰培养结果使用阿莫西林、头孢克肟等抗生素治疗。神经系统并发症如脑炎发生率低于1‰，需神经专科干预。家长需观察孩子恢复期有无异常疲倦、持续咳嗽、精神萎靡等症状，必要时进行胸片、心肌酶谱等检查。
建议患儿康复后保持1-2周适度休息，避免剧烈运动。饮食注意补充优质蛋白和维生素，保证充足睡眠。若出现活动后胸闷、夜间阵发性咳嗽或认知功能异常，应及时到儿科复诊。定期接种流感疫苗是预防再次感染的有效手段。