疟疾经过及时规范的治疗通常可以治愈。多数疟疾患者通过早期诊断和正确用药能够有效清除体内疟原虫，实现临床痊愈。但治疗结局可能受耐药性、并发症等因素影响。
1、及时规范治疗
疟疾的治疗以抗疟药物为主，常用药物包括双氢青蒿素哌喹片、磷酸氯喹片等。对于恶性疟原虫感染，世界卫生组织推荐以青蒿素为基础的联合疗法，如蒿甲醚-苯芴醇组合。规范完成疗程后，大多数患者血涂片检查可转阴，发热等症状完全消失。
2、耐药性问题
部分地区的间日疟原虫对氯喹产生耐药性，恶性疟原虫对青蒿素类药物敏感性降低的情况也有报道。此时需要调整治疗方案，如采用青蒿琥酯注射液联合多西环素等二线药物，或延长用药周期。及时更换有效药物后仍可获得较好疗效。
3、并发症处理
重症疟疾如脑型疟疾可能合并多器官功能损害，需在抗疟治疗基础上进行对症支持治疗。通过静脉注射青蒿琥酯配合甘露醇脱水降颅压、纠正电解质紊乱等措施，多数患者神经功能可逐渐恢复。但严重溶血导致的肾功能衰竭可能影响预后。
确诊疟疾后应尽早就医，严格按照医嘱完成全程治疗。治疗期间需定期复查血涂片监测疟原虫清除情况，切勿自行减量或停药。疫区旅行者出现发热症状要及时进行疟原虫检测，早发现早治疗可显著改善预后。临床治愈后仍需注意防蚊措施，防止重复感染。