阿莫西林常见的副作用主要包括胃肠道反应、过敏反应、神经系统症状、肝肾影响以及二重感染等。作为青霉素类抗生素，其不良反应发生率较低，但需警惕个体差异。
1、胃肠道反应
阿莫西林可能直接刺激胃黏膜，引起恶心、呕吐或腹泻。约1%-10%的患者可能出现此类症状，通常建议饭后服用以减轻刺激，严重时可出现抗生素相关性肠炎。
2、过敏反应
约0.7%-4%的用药者可能出现皮疹、荨麻疹等过敏表现。极少数患者（0.004%-0.04%）可能发生过敏性休克，表现为呼吸困难、血压下降，需立即停药并急救处理。
3、神经系统症状
大剂量使用时可能引发头痛、头晕或失眠，与药物透过血脑屏障影响中枢神经递质有关。老年患者或肾功能不全者更易出现此类反应。
4、肝肾影响
长期用药可能引起血清转氨酶暂时性升高，停药后多可自行恢复。肾功能不全患者需调整剂量，否则可能导致药物蓄积引发癫痫样发作。
5、二重感染
广谱抗菌作用可能破坏正常菌群平衡，导致念珠菌感染或艰难梭菌过度增殖，表现为鹅口疮或伪膜性肠炎。接受超过7天疗程者发生风险增加2-3倍。
使用阿莫西林期间应严格遵循医嘱，出现持续性腹泻、皮肤黏膜出血或重度皮疹需立即停药。青霉素过敏者禁用，用药前建议进行皮试筛查。治疗期间注意监测肝肾功能，避免与丙磺舒等影响肾排泄药物联用。