核酸检测的方法主要有实时荧光RT-PCR法、等温扩增技术以及基因测序法等，需根据检测目的选择合适方式。
1、实时荧光RT-PCR法
该方法通过逆转录酶将病毒RNA转化为DNA，再利用荧光探针标记的PCR技术进行扩增检测。其灵敏度可达95%以上，能精准识别新冠病毒、流感病毒等病原体的特异性基因片段，是目前诊断感染性疾病的金标准。此方法需在PCR实验室完成，检测时间通常为2-4小时，广泛用于医院和疾控中心的临床诊断。
2、等温扩增技术
包括环介导等温扩增技术（LAMP），可在60-65℃恒温条件下快速扩增核酸，无需复杂的热循环仪器。与RT-PCR相比，其操作更简便，30-60分钟即可出结果，适用于口岸检疫、基层医疗机构等现场快速筛查。但该方法对引物设计要求较高，可能出现非特异性扩增，需配合比色法或浊度法判读结果。
3、基因测序法
采用高通量测序技术对病毒全基因组进行分析，主要用于变异毒株监测和溯源研究。二代测序可同时检测数百万条DNA片段，准确识别奥密克戎等变异株的特异性突变位点。全基因组测序需3-5天完成，成本较高，通常用于科研机构或公共卫生部门的流行病学调查，普通临床检测较少使用。
进行核酸检测时需前往具备资质的医疗机构，采样后避免立即进食饮水。检测前30分钟勿吸烟或嚼口香糖，采样过程中应规范佩戴口罩，与前后人员保持1米以上距离。若出现检测结果异常，应及时联系疾控部门进行复核检测。