先天性甲状腺功能减退的治愈概率通常较低，多数患儿需终身治疗，但及时规范用药可有效控制病情。其预后主要与治疗时机、病因类型以及用药依从性密切相关。
1、治疗时机
出生后3个月内开始规范治疗的患儿，体格和智力发育通常接近正常水平。若超过6个月才开始干预，可能出现不可逆的神经发育损伤，影响语言能力和运动协调性。
2、病因类型
甲状腺发育不全或异位等结构异常导致的甲状腺功能减退，通常无法自行恢复功能，需持续替代治疗。而暂时性甲状腺功能减退多见于母体抗体影响或碘缺乏等情况，部分患儿在6个月至3岁期间可能逐渐恢复甲状腺功能。
3、用药依从性
规律服用左甲状腺素钠并定期监测TSH、FT4水平，可使90%以上患儿维持正常代谢状态。但自行停药或剂量不足会导致促甲状腺激素持续升高，引发生长迟缓和智力障碍。
该病需每3-6个月复查甲状腺功能，根据生长发育情况调整药量。建议家长严格遵循医嘱用药，避免听信偏方或擅自更改治疗方案，确保患儿获得最佳预后效果。