脓肿分枝杆菌感染的治疗时间一般为6~12个月，具体疗程需根据感染部位、病情严重程度以及患者免疫状态等因素综合判断。部分复杂病例可能需要更长时间，需由医生评估后制定个体化方案。
1、感染部位
不同部位的脓肿分枝杆菌感染治疗时长有所差异。肺部感染通常需要至少12个月的联合抗生素治疗，皮肤或软组织感染可能缩短至6~9个月，而播散性感染或合并免疫缺陷者往往需要12个月以上治疗。
2、病情严重程度
局限性病灶对药物反应较好时，疗程可能控制在6~8个月。对于存在空洞性肺病变、骨髓炎或中枢神经系统感染等严重情况，常需延长至12~18个月，必要时需配合外科清创手术。
3、患者免疫状态
HIV感染者等免疫抑制患者需终身进行抗分枝杆菌治疗，同时需进行抗病毒治疗恢复免疫功能。免疫功能正常者完成标准疗程后，仍需持续随访1年以防复发。
治疗期间应严格遵医嘱使用克拉霉素、阿米卡星、头孢西丁等联合用药方案，并定期进行痰培养、影像学检查和药物浓度监测。出现药物不良反应时需及时就医调整方案，切忌自行减药或停药。完成疗程后需每3个月复查1次，持续观察1~2年以确认根治效果。