复方南板蓝根与复方板蓝根的主要区别在于药材来源、成分组成以及功效侧重。两者均为中成药，但具体应用需根据病情在医生指导下选择。
1、药材来源不同
复方南板蓝根的主要成分是南板蓝根，来源于爵床科植物马蓝的干燥根茎。复方板蓝根则以十字花科植物菘蓝的干燥根为原料。两者虽名称相似，但植物基源不同。
2、成分组成差异
复方南板蓝根通常配伍有紫花地丁、蒲公英等成分，增强了清热解毒的功效。复方板蓝根常与大青叶等药材组方，更注重抗病毒作用。两者辅料和制备工艺也存在区别，可能影响药物吸收效果。
3、功效侧重不同
复方南板蓝根侧重解毒利咽，对咽喉肿痛、口舌生疮效果更显著。复方板蓝根长于防治流感、腮腺炎等病毒感染性疾病。临床数据显示，复方板蓝根对呼吸道病毒抑制率可达60%以上，而复方南板蓝根在抗炎镇痛方面更具优势。
这两种药物均需辨证使用，风寒感冒者不宜服用。用药期间需忌食辛辣刺激食物，若出现皮疹、腹泻等不良反应应立即停药。建议在中医师指导下根据具体症状选择合适药物，避免自行盲目用药。