肛瘘的治疗药物需根据病情遵医嘱选择，常见药物包括抗生素、外用药膏及中成药栓剂等，必要时需结合手术治疗。具体如下：
1、抗生素治疗
肛瘘合并感染时可使用头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊等口服抗生素控制炎症，减轻局部红肿和疼痛。用药期间需观察体温变化，若出现发热需及时复诊。
2、外用药物
局部涂抹红霉素软膏、莫匹罗星软膏等抗菌药膏可预防创面感染。配合高锰酸钾溶液坐浴能促进瘘管清洁，每日2次温水坐浴有助于缓解肛周不适。
3、中成药栓剂
痔疮栓、复方角菜酸酯栓等栓剂可通过直肠给药发挥消炎止痛作用，使用时需保持肛门清洁，建议排便后给药以保证药物吸收。
4、止痛药物
急性发作期疼痛剧烈时，可在医生指导下短期服用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠肠溶片等非甾体抗炎药，但需注意胃肠道反应等副作用。
肛瘘存在反复感染风险，药物治疗仅能暂时缓解症状。建议及时到肛肠外科就诊，通过肛瘘切开术、挂线疗法等手术方式彻底清除瘘管。治疗期间保持清淡饮食，避免辛辣刺激食物，每日清洁肛周并更换透气棉质内裤。