核磁共振成像在医学检查中具有较高的软组织分辨率，对中枢神经系统、骨骼肌肉系统、腹部盆腔、心脏及大血管、乳腺等部位的检查效果较为显著。具体选择需根据病情和医生建议决定。
1、中枢神经系统
核磁共振对脑部及脊髓的病变显示效果优异，能清晰呈现脑肿瘤、脑梗死、脑出血、多发性硬化等疾病。其多方位成像特点可辅助判断脑神经损伤程度，例如垂体微腺瘤的检出率可达90%以上，较CT检查更敏感。
2、骨骼肌肉系统
适用于检查关节软骨、半月板、韧带等结构，对膝关节半月板撕裂、肩袖损伤、骨肿瘤等病变的检出准确率超过95%。其无创性特点可动态观察软组织水肿、肌腱炎症等细微变化。
3、腹部盆腔
对肝脏局灶性结节增生、胰腺肿瘤、前列腺癌等实体器官病变具有诊断价值，弥散加权成像技术可鉴别良恶性肿瘤。在妇科领域能清晰显示子宫畸形、卵巢囊肿等结构异常，对子宫内膜癌分期准确率达85%以上。
4、心脏及大血管
心脏电影序列可评估心肌收缩功能，延迟增强扫描能检测心肌纤维化病灶。对主动脉夹层、先天性心脏病等血管畸形具有三维立体成像优势，空间分辨率可达亚毫米级别。
5、乳腺检查
作为乳腺X线摄影的补充手段，对致密型乳腺中的早期乳腺癌检出敏感度达90%，特别适用于携带BRCA基因突变的高危人群筛查，能发现小于5mm的微小病灶。
进行核磁共振检查前需去除金属物品，心脏起搏器植入者等特定人群需提前告知医生。检查过程中保持体位稳定，根据临床需求可能需配合造影剂增强扫描，检查后适当增加饮水量促进造影剂排泄。