核酸检测阴性通常可以初步排除感染，但并不能完全排除，需结合具体情况综合判断。检测结果可能受多种因素影响，必要时应重复检测。
1、病毒潜伏期
若处于感染后1-3天的窗口期，体内病毒载量未达到检测阈值，可能出现假阴性结果。这种情况常见于密切接触者早期筛查，需在暴露后第5天、第7天分别复测。
2、采样操作不当
鼻咽拭子未采集到脱落细胞或采样部位错误会导致假阴性。研究显示规范操作下核酸阳性率可达95%，但基层采样失误率可达10%-15%，建议选择专业机构检测。
3、病毒载量波动
呼吸道分泌物中的病毒存在间歇性排出特点，载量可能在检测时处于波谷。对于有明确流行病学史者，即使首次阴性仍需48小时后复测，连续两次阴性更可靠。
4、检测试剂灵敏度
不同试剂对变异毒株的检出率存在差异，部分试剂对奥密克戎变异株的灵敏度下降约30%。临床建议采用双靶标检测试剂，可提高检出准确率至99.2%。
若核酸检测阴性但出现发热、咳嗽等症状，或存在明确高危暴露史，建议间隔24小时以上再次检测，并配合血清抗体检测。日常仍需做好个人防护，出现疑似感染体征时及时到发热门诊就诊，由医生结合临床表现、流行病学史及其他实验室检查综合判断。