肛门囊肿手术后通常需要2~4周恢复，但具体时间因囊肿大小、手术方式及个人体质差异而有所不同。术后恢复可分为急性期、恢复期和延迟愈合期三个阶段，需通过日常护理、药物治疗等措施促进康复。
1、术后1周内（急性期）
此时创面存在渗液和轻微疼痛，需保持肛门清洁并卧床休息。每日用1:5000高锰酸钾溶液坐浴2次，每次10分钟，可减轻局部肿胀。遵医嘱口服阿莫西林胶囊、头孢克肟片等抗生素预防感染，若疼痛明显可短期使用布洛芬缓释胶囊止痛。需特别注意排便后及时清洗，避免用力擦拭。
2、术后2~4周（恢复期）
创面肉芽组织逐渐生长，渗液减少。此时可逐步恢复轻体力活动，但应避免久坐或剧烈运动。饮食需增加芹菜、燕麦等膳食纤维摄入，配合乳果糖口服溶液软化粪便。部分患者可能出现肛门坠胀感，可通过红外线理疗促进血液循环。此阶段约70%患者能达到临床愈合标准。
3、超过4周（延迟愈合期）
若存在糖尿病、贫血等基础疾病，或术后发生创面感染，可能延长恢复时间至6~8周。需加强创面换药，必要时进行脓液培养，根据结果调整抗生素如左氧氟沙星片的使用。反复渗液者可采用藻酸盐敷料促进组织修复，伴有肉芽过度增生时可使用硝酸银溶液局部处理。
术后应每日观察创面愈合情况，若出现持续出血、脓性分泌物增多或体温升高等异常，应立即返院检查。恢复期间需穿着宽松棉质内衣，避免骑行、深蹲等增加肛门压力的动作。术后1个月、3个月需常规复查肛门镜，评估括约肌功能及有无复发迹象。严格遵循医嘱进行扩肛训练者，可有效降低肛门狭窄发生率。