马拉色菌毛囊炎通常可以遵医嘱使用抗真菌类药膏、角质剥脱类药膏或辅助清洁类洗剂等，常用药物包括酮康唑乳膏、联苯苄唑乳膏、盐酸特比萘芬凝胶等，具体需根据病情选择。
1、酮康唑乳膏
该药物属于广谱抗真菌药，能够抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，从而破坏真菌结构。每日1-2次涂抹于患处，可有效杀灭马拉色菌，缓解皮肤瘙痒和丘疹症状。使用时应避免接触眼周黏膜。
2、联苯苄唑乳膏
通过抑制真菌细胞膜合成发挥作用，对马拉色菌有较强抗菌活性。临床多采用每日晚间涂抹一次的用药方式，需连续使用2-4周。部分患者可能出现局部灼热感等刺激反应。
3、盐酸特比萘芬凝胶
属于丙烯胺类抗真菌药物，通过干扰真菌固醇生物合成起效。凝胶剂型更易渗透毛囊部位，适用于炎症明显的皮损。建议每日早晚各使用一次，用药后需注意防晒。
病情顽固或范围较大时，可配合使用二硫化硒洗剂进行全身清洁，每周2-3次辅助治疗。日常需注意保持皮肤干爽，穿着透气衣物，避免过度搔抓和糖皮质激素滥用。如果用药两周后无改善或出现渗液、化脓等情况，应及时到皮肤科进行真菌镜检和培养，调整治疗方案。