肺孢子菌肺炎（PCP）与肺孢子菌肺炎（PJP）属于同一种疾病，两者的区别主要在于病原体命名方式的更新。肺孢子菌肺炎是由耶氏肺孢子菌感染引起的机遇性肺炎，常见于免疫功能低下人群，其临床表现和治疗方案均一致。
耶氏肺孢子菌过去被误认为属于原虫，故称为卡氏肺囊虫肺炎（PCP）。随着分子生物学研究进展，该病原体被重新归类为真菌，并更名为耶氏肺孢子菌，因此疾病名称更新为肺孢子菌肺炎（PJP）。两者的病原体检测方法均为肺泡灌洗液六胺银染色或PCR检测，治疗首选复方磺胺甲噁唑，重症患者需联合糖皮质激素治疗。
免疫功能正常人群通常不会感染该病原体。HIV感染者、器官移植受者、长期使用免疫抑制剂的患者属于高危人群，可能出现渐进性呼吸困难、干咳、低氧血症等典型症状。临床诊疗中不再使用PCP这一旧称，统一采用PJP作为规范术语。若出现相关症状应及时进行胸部CT和病原学检查，确诊后需在医生指导下规范用药，避免擅自调整药物剂量。