清理扁桃体结石一般需挂耳鼻喉科或口腔科，具体科室选择需结合实际情况。若结石位置较深或伴随咽喉不适症状，建议优先选择耳鼻喉科；若结石较表浅且需日常护理指导，可选择口腔科。
1、耳鼻喉科
耳鼻喉科是处理扁桃体结石的主要科室。医生可通过喉镜等器械明确结石位置和大小，采用专业器械进行冲洗或刮除。对于反复发作或体积较大的结石，可能需结合抗感染治疗，如使用头孢克肟片、阿莫西林胶囊等药物控制局部炎症。术后医生还会指导患者改善口腔卫生习惯，降低复发风险。
2、口腔科
当扁桃体结石较小且位置靠近口腔时，可至口腔科就诊。口腔医生会评估结石与周围组织的关系，使用牙科器械轻柔取出。此外，口腔科能提供超声波洁牙、舌苔清洁等预防性措施，减少食物残渣滞留。对于合并牙龈炎的患者，可能配合复方氯己定含漱液等药物进行口腔消毒。
3、其他情况
若患者出现发热、吞咽困难等严重症状，可能需转诊至内科进行全身抗感染治疗。部分医院设有咽喉疾病专病门诊，也可作为就诊选择。
发现扁桃体结石时避免自行用棉签或尖锐物品掏挖，以免损伤黏膜引发感染。日常应保持饭后漱口、正确使用牙线清洁牙齿间隙。若结石反复形成或伴有持续性口臭，建议尽早就医排查慢性扁桃体炎等潜在疾病。