激光去疣过程中通常会有轻微的疼痛感，但多数人可以耐受。疼痛程度因人而异，主要与个人对疼痛的敏感度、治疗部位以及疣体大小等因素有关。
激光治疗时，仪器释放的高能量光束会对皮肤产生热效应，可能引起刺痛或灼热感。为减轻不适，医生通常会提前在治疗区域涂抹局部麻醉药膏或进行局部麻醉注射，从而有效缓解疼痛。治疗后可能出现短暂的红肿、结痂，此时需避免抓挠，保持创面清洁干燥，防止感染。
若对疼痛较为敏感，可在治疗前主动告知医生，以便调整麻醉方式或采取其他镇痛措施。术后若出现持续剧烈疼痛、渗液等异常情况，应及时复诊排查感染风险。