甲硝唑呋喃唑酮栓与甲硝唑栓在成分和适应症上存在差异，不能直接等同。甲硝唑呋喃唑酮栓为复方制剂，含有甲硝唑和呋喃唑酮两种成分，而甲硝唑栓仅含甲硝唑。具体使用需根据病情在医生指导下选择。
甲硝唑呋喃唑酮栓中的甲硝唑具有抗滴虫和厌氧菌作用，常用于滴虫性阴道炎或混合感染的治疗；呋喃唑酮则对部分革兰氏阴性菌、阳性菌有抑制作用。甲硝唑栓仅含甲硝唑成分，主要针对滴虫性阴道炎、细菌性阴道病等由敏感菌引起的感染。复方制剂扩大了抗菌谱，但可能增加不良反应风险，如局部灼热感、过敏反应等。
两种药物均需阴道给药，使用期间应避免性生活，保持外阴清洁。患者不可自行替换药物，用药前需经妇科检查明确感染类型，遵医嘱规范使用。若用药后出现严重刺激症状或过敏反应，应立即停药并就医。