肛门疼痛的治疗方法包括日常护理、药物治疗、物理治疗、手术治疗以及针对原发病的治疗等，需根据具体病因选择合适方案。
1、日常护理
保持肛周清洁干燥，排便后用温水清洗或使用湿厕纸擦拭。调整饮食结构，增加膳食纤维摄入，如蔬菜、水果，多饮水软化大便，避免辛辣刺激性食物。避免久坐或长时间用力排便，可适当进行提肛运动促进局部血液循环。
2、药物治疗
肛裂引起的疼痛可遵医嘱使用硝酸甘油软膏、地尔硫卓软膏等缓解括约肌痉挛。痔疮急性发作时可用复方角菜酸酯栓、普济痔疮栓等栓剂。细菌感染引起的肛周脓肿需口服头孢克肟片、阿莫西林胶囊等抗生素。疼痛剧烈者可短期使用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片等止痛药物。
3、物理治疗
血栓性外痔早期可采用温水坐浴，每日2次，每次15分钟，水温控制在40℃左右。红外线照射或微波治疗可促进炎症吸收，缓解水肿。慢性肛裂患者可尝试生物反馈治疗改善排便习惯。
4、手术治疗
反复发作的混合痔可行痔上黏膜环切术（PPH），肛裂经保守治疗无效者需行侧方内括约肌切开术。复杂性肛瘘需采用挂线疗法或瘘管切开术，肛周脓肿应及时行切开引流术。
5、原发病治疗
炎症性肠病引起的肛门溃疡需使用美沙拉嗪肠溶片控制肠道炎症。肛周湿疹需外用丁酸氢化可的松乳膏联合氯雷他定片抗过敏治疗。肿瘤性疾病需根据病理类型选择放化疗或根治性切除术。
出现肛门疼痛建议及时至肛肠科就诊，通过直肠指诊、肛门镜等检查明确病因。避免自行使用强效镇痛药掩盖病情，治疗期间需保持规律作息，穿着宽松透气内衣。术后患者应定期换药，观察创面愈合情况，预防继发感染。