纤维支气管镜检查属于侵入性操作，可能会引起一定不适，但多数情况下在局部麻醉和镇静措施下，患者可以耐受。具体不适程度与麻醉方式、个人敏感度等因素有关。
检查过程中，医生通常会在鼻腔、咽喉等部位使用利多卡因等局部麻醉药物，以减轻刺激感。对于紧张或敏感的患者，可能联合使用镇静药物帮助放松。操作时经过声门进入气管可能引发短暂咳嗽反射，但麻醉起效后不适感会明显减轻。操作时间一般控制在10~30分钟，若发现病变需要活检，可能会有轻微牵拉感或出血，但通常无剧烈疼痛。
检查后建议2小时内禁食禁水，避免误吸。24小时内减少说话、避免用力咳嗽，以防喉部黏膜损伤。若出现持续胸痛、咯血增多或呼吸困难，需立即就医。检查前应与医生充分沟通自身病史和药物过敏情况，配合医生进行深呼吸训练，有助于顺利完成检查。