肛瘘癌变的可能性较小，但长期未治疗的慢性肛瘘存在一定恶变风险。多数情况下，肛瘘经规范治疗后预后良好，但若病程超过10年以上且反复感染，可能增加局部组织异常增生风险。
肛瘘发生癌变通常与长期慢性炎症刺激有关。持续存在的瘘管分泌物、细菌感染及局部组织反复修复过程可能导致细胞DNA损伤，进而诱发异常增殖。临床数据显示，病程超过10年的复杂肛瘘患者中，约有0.1%-0.3%可能发展为肛管鳞状细胞癌或腺癌。这类病例多表现为瘘管分泌物性质改变、出血量增加或出现菜花样肿物。
规范治疗是预防癌变的关键。肛瘘确诊后应尽早行肛瘘切除术、挂线疗法等外科治疗，彻底清除感染灶和坏死组织。术后定期换药、保持肛门清洁可有效降低复发风险。对于病程较长或反复发作的复杂性肛瘘，建议每6-12个月进行肛门指诊和肠镜检查，必要时进行病理活检。
出现肛周肿痛、渗液等症状应及时就诊，通过肛肠科专科检查明确诊断。已确诊患者应严格遵医嘱进行规范治疗和术后随访，避免自行使用偏方或拖延治疗。保持规律作息、避免久坐及辛辣饮食等生活方式调整，有助于促进术后恢复和预防复发。