木瓜作为常见水果及中药材，一般具有促进消化、抗氧化、缓解肌肉酸痛、辅助改善皮肤状态、抗炎等功效和作用。但作为食物时，其医疗效果有限，需结合具体情况综合判断。
1、促进消化
木瓜中含有的木瓜蛋白酶可分解蛋白质，帮助胃肠道消化吸收。其膳食纤维成分还能促进肠道蠕动，对于功能性消化不良有一定辅助改善作用。
2、抗氧化
富含维生素C和β-胡萝卜素等抗氧化物质，能中和自由基，延缓细胞氧化损伤。研究表明其提取物对清除超氧阴离子自由基有效率可达68%以上。
3、缓解肌肉酸痛
中医认为木瓜具有舒筋活络作用，现代药理学显示其含有的齐墩果酸等成分能抑制炎症因子释放，缓解运动后乳酸堆积引发的肌肉僵硬。
4、辅助改善皮肤状态
所含的维生素A原可在体内转化为视黄醇，促进表皮细胞更新。临床将木瓜提取物用于皮肤修复类药膏，对皮肤干燥有改善作用。
5、抗炎
实验显示木瓜中的黄酮类化合物对二甲苯所致的小鼠耳肿胀抑制率达42.3%，其水提物可降低TNF-α等促炎因子水平，但直接抗炎效果仍需更多临床验证。
若需用于疾病治疗，应在中医师指导下配伍使用。出现持续性消化道症状或肌肉疼痛时，应及时就诊查明病因。