磷霉素氨丁三醇散作为抗菌药物，主要用于治疗敏感菌引起的泌尿系统感染性疾病，如急性膀胱炎、尿道炎、肾盂肾炎、无症状性菌尿以及预防复发性尿路感染等。
1、急性膀胱炎
磷霉素氨丁三醇散在尿液中浓度较高，可通过抑制细菌细胞壁合成发挥杀菌作用，常用于治疗大肠埃希菌等革兰阴性杆菌引起的急性单纯性膀胱炎，可缓解尿频、尿急、排尿灼痛等症状。
2、尿道炎
该药物对淋球菌、大肠埃希菌等尿道炎常见致病菌具有抗菌活性，适用于急性单纯性尿道炎的治疗，尤其适用于对其他抗生素耐药的情况。
3、肾盂肾炎
对于无并发症的轻症肾盂肾炎患者，若致病菌对磷霉素敏感，可短期应用该药物控制感染，但中重度肾盂肾炎需联合其他抗菌药物。
4、无症状性菌尿
部分老年女性或留置导尿管患者可能出现无症状性菌尿，若存在治疗指征，可遵医嘱使用磷霉素氨丁三醇散进行干预。
5、预防复发性尿路感染
对于反复发作的尿路感染患者，在急性感染控制后，可在医生指导下采用小剂量、长疗程的磷霉素氨丁三醇散进行预防性治疗。
磷霉素氨丁三醇散需在医生指导下规范使用，治疗期间需注意观察疗效及不良反应。对药物过敏者禁用，严重肝肾功能不全者慎用。建议用药期间增加饮水量促进排尿，避免憋尿和过度劳累，若出现发热、腰痛或血尿等病情加重表现应及时复诊。