马拉色菌毛囊炎的首选药物主要包括外用抗真菌药物、外用洗剂以及口服抗真菌药物等类型，具体用药需根据病情严重程度在医生指导下选择。
1、外用抗真菌药物
此类药物可直接抑制马拉色菌生长。酮康唑乳膏能破坏真菌细胞膜结构，联苯苄唑乳膏通过抑制真菌麦角固醇合成发挥疗效，硝酸咪康唑乳膏则具有广谱抗真菌作用，适用于轻中度皮损的局部治疗。
2、外用洗剂
二硫化硒洗剂含有抗真菌成分，可减少皮肤表面油脂分泌，建议每周2-3次局部清洗。酮康唑洗剂能有效清除毛囊内定植的真菌，使用时需在患处停留5分钟后再冲洗。
3、口服抗真菌药物
对于泛发性或顽固性病例，伊曲康唑胶囊可抑制真菌细胞色素P450酶活性，氟康唑胶囊能干扰真菌细胞膜合成，通常需要连续服用2-4周，用药期间需监测肝功能。
4、辅助治疗药物
瘙痒明显者可短期使用氯雷他定片等抗组胺药物缓解症状。合并细菌感染时可外用莫匹罗星软膏，但不建议单独使用糖皮质激素类药物。
治疗期间需避免搔抓患处，穿着透气棉质衣物，保持皮肤清洁干燥。马拉色菌毛囊炎易复发，建议在皮损消退后继续巩固治疗1-2周，并定期复诊评估疗效。切勿自行增减药量或混合使用多种抗真菌药物，以免产生耐药性或加重皮肤刺激反应。