马拉色菌毛囊炎的治疗药物需根据病情严重程度选择，常用药物包括酮康唑乳膏、联苯苄唑乳膏、二硫化硒洗剂、伊曲康唑胶囊以及抗炎药物等，通常需联合使用以达到较好效果。
1、酮康唑乳膏
酮康唑是广谱抗真菌药物，可直接抑制马拉色菌细胞膜合成，破坏真菌结构。临床研究显示，外用酮康唑乳膏能有效减少毛囊炎病灶数量，缓解瘙痒和红肿症状，适用于轻中度患者。
2、联苯苄唑乳膏
联苯苄唑通过抑制真菌麦角固醇合成发挥作用，对马拉色菌有较强抗菌活性。其渗透性较好，能深入毛囊内部杀灭真菌，与酮康唑联用可降低复发率。
3、二硫化硒洗剂
该洗剂含有2.5%二硫化硒成分，具有抗真菌和抑制皮脂分泌作用。每周使用2-3次清洗患处，可减少皮肤表面真菌载量，常作为辅助治疗手段。
4、伊曲康唑胶囊
对于泛发性或顽固性病例，需短期口服伊曲康唑。该药通过肝脏代谢，能系统性抑制真菌生长，疗程通常为1-2周，需监测肝功能指标。
5、抗炎药物
伴有明显炎症反应时，可短期使用氢化可的松乳膏等弱效糖皮质激素，但需避免长期使用以防皮肤萎缩。非甾体抗炎药如炉甘石洗剂也可缓解瘙痒。
马拉色菌毛囊炎易复发，建议在医生指导下规范用药疗程。治疗期间需保持皮肤清洁干燥，穿着透气衣物，避免过度出汗。若合并免疫缺陷或糖尿病等基础疾病，需积极控制原发病。外用药物效果不佳时，应及时复诊调整治疗方案。