肉豆蔻作为一味中药，在中医治疗中具有温中散寒、涩肠止泻、行气止痛、固摄止泻以及外用驱寒止痛等特殊应用。其性味辛温，归脾、胃、大肠经，常用于调理中焦虚寒及肠道功能异常等证候。
1、温中散寒
肉豆蔻辛温之性可驱散脾胃寒邪，适用于脾胃虚寒引起的脘腹冷痛、食欲不振。其温通作用能促进中焦阳气升发，改善因寒凝导致的消化功能减弱，常与干姜、肉桂等配伍增强疗效。
2、涩肠止泻
对于久泻久痢、大便清稀等症，肉豆蔻通过收敛固涩作用减少肠道过度蠕动，常与诃子、五味子等固涩药同用。煨制后涩肠功效增强，尤其适合脾肾阳虚导致的五更泻。
3、行气止痛
肉豆蔻兼具行气导滞功效，能缓解寒凝气滞引起的腹胀、肠鸣。与木香、砂仁等理气药配伍时，可改善胃肠气机阻滞，消除胀满疼痛。
4、固摄止泻
针对脾胃虚弱、固摄无力的慢性泄泻，肉豆蔻通过温补脾肾增强固摄能力。在四神丸等经典方剂中，与补骨脂、吴茱萸协同发挥温肾暖脾、固肠止泻的作用。
5、外用驱寒止痛
研末调敷或制成膏药外用时，肉豆蔻可缓解寒湿痹痛。其辛散温通之性有助于驱散局部寒邪，改善关节冷痛、肌肉拘挛等症状。
使用肉豆蔻需注意其辛温燥烈之性，阴虚火旺及湿热泻痢者禁用。入汤剂常用量为3-10克，煨制后减毒存效。建议在中医师指导下根据具体证型配伍使用，避免单独过量服用引发口干、便秘等不良反应。