使君子作为一味传统中药，一般具有驱虫消积、健脾和胃、行气止痛、止泻止痢、增强免疫等功效和作用。其临床应用需在医生指导下进行，避免自行用药。
1、驱虫消积
使君子中含有的使君子酸钾等成分可麻痹蛔虫头部，抑制虫体活性，促进肠道寄生虫排出，对蛔虫病、蛲虫病等肠道寄生虫感染具有驱除效果。
2、健脾和胃
该药材能促进胃液分泌，改善脾胃虚弱引起的食欲不振、腹胀等症状，其甘温性质有助于调和脾胃功能，缓解消化不良问题。
3、行气止痛
所含挥发油成分可调节肠道平滑肌运动，缓解气滞引起的腹部胀痛，对于小儿疳积伴随的腹痛症状有改善作用。
4、止泻止痢
使君子煎剂对痢疾杆菌等肠道致病菌有一定抑制作用，能减轻湿热下注导致的腹泻、痢疾等肠道炎症反应。
5、增强免疫
现代药理学研究表明，其水提取物能促进淋巴细胞转化，增强巨噬细胞吞噬能力，辅助提升机体免疫功能。
使用使君子时需注意炒制后入药可减轻毒副作用，驱虫治疗宜空腹服用。蛔虫性肠梗阻等急腹症患者禁用，孕妇及婴幼儿需在中医师指导下使用。服用后可能出现呃逆、恶心等不良反应，建议配合陈皮等理气药物减轻胃肠刺激。