吴茱萸汤与其他温中散寒方在药物组成、主治证型及作用特点上存在明显区别。其差异主要体现在针对的病机侧重、药物配伍及适用症状等方面，需根据患者具体证候选择使用。
1、主治证型不同
吴茱萸汤主要针对肝胃虚寒证，尤其是寒邪侵袭厥阴肝经引起的头痛、呕吐涎沫等症状。其他温中散寒方如理中丸、小建中汤等，则以脾胃虚寒为核心病机，侧重于脘腹冷痛、腹泻等中焦虚寒症状。两者证候定位存在肝经与脾经的差异。
2、药物配伍特点不同
吴茱萸汤以吴茱萸为君药，配伍人参、生姜、大枣，着重温肝暖胃、降逆止呕。其他方剂如附子理中丸则在干姜、白术基础上加附子，增强温阳散寒力度；小建中汤则配伍饴糖、白芍，体现温中补虚、缓急止痛的配伍思路，与吴茱萸汤的降逆止呕方向不同。
3、作用部位差异
吴茱萸汤作用重点在肝胃二经，善治肝寒犯胃导致的巅顶头痛、食后呕吐等症。相比之下，理中汤类方剂作用靶点集中于脾胃，对中焦运化失常引起的腹胀、便溏等症状更具针对性。这种归经差异直接影响临床选方指征。
使用温中散寒类方剂前，建议经中医师辨证明确病机。肝胃同病者多选吴茱萸汤，单纯脾胃虚寒则更适合理中丸等方。自行用药可能因辨证不准导致疗效不佳或加重不适，服药期间需忌食生冷并注意腹部保暖。