阴茎排尿时疼痛可能与生理性刺激有关，也可能是尿道炎、前列腺炎、尿路结石或性传播疾病等病理因素导致，建议及时就医明确病因。
1、生理性原因
饮水不足或长时间憋尿可能导致尿液浓缩，高浓度的代谢废物刺激尿道黏膜，引起排尿时阴茎刺痛感。这类情况通常调整饮水习惯、避免憋尿后即可缓解。
2、尿道炎
细菌感染引起的尿道黏膜炎症，常伴随尿频、尿急及尿道口红肿。致病菌多为大肠杆菌或葡萄球菌，可通过尿常规及细菌培养确诊，遵医嘱使用头孢克肟片、左氧氟沙星片、阿莫西林胶囊等抗生素治疗。
3、前列腺炎
前列腺充血肿胀可能压迫尿道，除了排尿疼痛，还可能出现会阴部胀痛、尿后滴白等症状。治疗可选用盐酸坦索罗辛缓释胶囊改善排尿，联合多沙唑嗪片、布洛芬缓释胶囊等药物控制炎症。
4、尿路结石
肾结石或输尿管结石移动时划伤尿道，可能引发剧烈绞痛并向腹股沟放射，常伴有血尿。直径小于6mm的结石可服用排石颗粒、双氯芬酸钠栓等促进排出，较大结石需体外冲击波碎石。
5、性传播疾病
淋球菌感染引起的淋病可产生黄色脓性分泌物，衣原体感染则会出现稀薄分泌物，确诊需进行病原体检测。治疗多采用注射用头孢曲松钠、阿奇霉素分散片等敏感抗生素。
日常需注意保持会阴清洁，避免不洁性行为。若疼痛持续超过24小时或伴随发热、血尿等症状，应及时到泌尿外科进行尿动力学检查、超声扫描等专业评估，早期规范治疗可有效预防并发症。