药物流产的较佳时间通常为停经49天内，此时孕囊较小且子宫敏感性较高，药流效果相对较好。过早或过晚进行药物流产，均可能影响流产效果并增加并发症风险。
1、孕周≤7周
此时孕囊直径通常≤2.5cm，子宫蜕膜组织与胚胎结合尚不紧密。米非司酮与米索前列醇联用可使子宫蜕膜变性坏死，促进宫颈软化，孕囊排出成功率可达90%以上，完全流产率约85%。此阶段药流后阴道出血时间通常为7-14天。
2、孕周7-9周
随着胚胎发育，绒毛与子宫壁附着更紧密。药流成功率可能下降至70-80%，不完全流产风险增加至10-15%。部分孕妇可能出现蜕膜排出不全，需行超声检查评估宫腔残留情况，必要时需进行清宫术。
3、孕周≥10周
此时胚胎骨骼开始形成，胎盘结构逐渐发育。单纯药物流产成功率不足50%，大出血风险增加3-5倍，宫腔感染发生率可达8-12%。临床上多建议采用手术流产方案，以确保妊娠组织完全清除。
建议确诊宫内妊娠后，在医生指导下尽早完成术前检查。用药期间需密切观察阴道出血量，服用米索前列醇后6小时内孕囊排出率最高，若24小时仍未排出需及时复诊。流产后2周应复查超声，确认宫腔恢复情况。