枯草杆菌二联活菌颗粒作为益生菌制剂，一般具有调节肠道菌群、缓解腹泻、改善消化不良、增强肠道免疫力以及减少抗生素相关副作用等功效和作用。其主要通过补充活性益生菌来维持肠道微生态平衡。
1、调节肠道菌群
枯草杆菌二联活菌颗粒含有活性的枯草杆菌和屎肠球菌，可直接补充肠道有益菌，抑制致病菌过度繁殖，从而恢复肠道菌群平衡。此作用对因菌群失调引起的腹胀、便秘等症状有改善效果。
2、缓解腹泻
该药物可通过竞争性抑制致病菌在肠道的定植，减少毒素产生，同时促进肠黏膜修复，适用于感染性或抗生素相关性腹泻。对于轮状病毒等引起的急性腹泻也可能有一定辅助治疗效果。
3、改善消化不良
益生菌能促进消化酶分泌，帮助分解食物中的蛋白质、脂肪等大分子物质，减轻因消化功能减弱导致的食欲不振、餐后腹胀等消化不良症状。
4、增强肠道免疫力
肠道菌群与免疫系统密切相关，该药物可通过调节肠道菌群结构，促进免疫球蛋白A分泌，加强肠道黏膜屏障功能，降低病原体入侵风险。
5、减少抗生素副作用
抗生素治疗可能破坏肠道正常菌群，服用枯草杆菌二联活菌颗粒可补充被抗生素杀灭的有益菌，预防或减轻抗生素相关性腹泻、伪膜性肠炎等并发症。
使用该药物时需注意与抗生素间隔2小时以上服用，避免高温溶解。若存在严重免疫缺陷或中心静脉导管留置等情况，需在医生指导下谨慎使用。储存时应置于阴凉干燥处以保持菌株活性。