马拉色菌毛囊炎的治疗药物需根据病情严重程度及个体差异进行选择，不存在单一“最有效”的药物。临床上通常采用外用抗真菌药、口服抗真菌药、辅助清洁、光动力治疗等方法综合干预。
1、外用抗真菌药
酮康唑乳膏可直接抑制马拉色菌的细胞膜合成，减少真菌增殖；联苯苄唑乳膏通过干扰真菌细胞色素代谢发挥作用。每日局部涂抹1-2次，需连续使用2-4周，皮损消退后应继续巩固治疗1周。
2、口服抗真菌药
伊曲康唑胶囊适用于范围广泛或反复发作的病例，该药物具有亲脂性，能在毛囊部位形成高浓度。通常采用冲击疗法，每日口服200mg，连续服用1周后停药，需监测肝功能指标。
3、辅助清洁治疗
硫磺皂清洗患处可调节皮肤pH值，抑制真菌过度增殖。使用时需注意控制频率，避免过度清洁导致皮肤屏障受损，建议每周使用2-3次为宜。
4、光动力治疗
对于顽固性病例，可采用5-氨基酮戊酸光动力疗法。该疗法通过选择性破坏毛囊内真菌结构发挥作用，需在专业医疗机构进行，治疗间隔为1-2周。
治疗期间应避免穿着不透气衣物，保持患处干燥清洁。建议在皮肤科医师指导下规范用药，切忌自行增减药量或混合使用多种抗真菌药物。伴有免疫功能异常或基础疾病的患者，需同时进行原发病治疗以提高疗效。