阴茎短小可能与先天性因素、内分泌异常、隐匿阴茎、后天因素等原因有关，通常可通过药物、手术等方式进行治疗。具体原因及治疗方法需由医生评估后确定。
1、先天性因素
部分男性可能存在先天性阴茎发育不良，可能与遗传或胚胎期发育异常有关。此类情况若伴随明显的功能障碍，可考虑在成年后通过阴茎延长术进行治疗，该手术通过切断部分韧带组织实现延长效果。
2、内分泌异常
生长激素缺乏或雄激素分泌不足会影响阴茎发育。对于青春期前发现的激素缺乏，可在医生指导下使用十一酸睾酮胶丸、重组人生长激素注射液等药物进行替代治疗，需严格掌握用药时机和疗程。
3、隐匿阴茎
由于耻骨前脂肪堆积或肉膜发育异常导致阴茎体埋藏，可通过隐匿阴茎矫正术进行治疗。手术需松解异常纤维索带并固定阴茎根部，术后需保持伤口清洁并预防感染。
4、后天因素
肥胖导致的脂肪堆积会使阴茎视觉上显小，建议通过控制饮食和增加运动减轻体重。外伤或感染引起的器质性损伤需针对原发病进行治疗，必要时进行阴茎重建手术。
发现阴茎短小时建议尽早就诊泌尿外科，通过激素检测、超声检查等手段明确病因。需注意避免自行服用雄激素类药物，不当使用可能导致骨骺提前闭合或肝功能损伤。成年患者若存在严重心理困扰，可联合心理科进行认知行为干预。治疗选择需综合考虑年龄、病因及个体需求，规范医疗机构的专业评估至关重要。