银杏酮酯滴丸与银杏叶滴丸的主要区别在于成分、功效以及临床应用等方面，两者均需在医生指导下使用。
1、成分不同
银杏酮酯滴丸的主要成分为银杏酮酯，是从银杏叶中提取的特定有效部位，含有较高浓度的萜类内酯及黄酮类化合物。银杏叶滴丸则通常以银杏叶标准提取物为原料，包含总黄酮醇苷和萜类内酯等多种活性成分，但具体组分比例与前者存在差异。
2、功效侧重不同
银杏酮酯滴丸因高度纯化的有效成分，在改善冠状动脉循环、抑制血小板聚集方面作用更为显著，常用于冠心病、心绞痛等心血管疾病的辅助治疗。银杏叶滴丸则侧重于扩张脑血管、改善微循环，多用于脑供血不足、认知功能减退及外周循环障碍等情况。
3、临床应用差异
临床研究表明，银杏酮酯滴丸对心肌缺血再灌注损伤具有更好的保护作用，其抗自由基氧化能力较强。而银杏叶滴丸在改善脑血流动力学参数、缓解耳鸣及眩晕症状方面应用更广泛，对阿尔茨海默病的辅助治疗效果得到更多循证支持。
4、副作用风险
两者均可能引起胃肠道不适或出血倾向，但银杏酮酯滴丸因成分浓缩度高，与抗凝药物合用时出血风险相对更高，需更严格监测凝血功能。
使用此类药物前应明确诊断，避免自行用药。心脑血管疾病患者需定期复查，服药期间出现牙龈出血、黑便等异常情况应立即停药并就医。特殊人群如孕妇、围手术期患者应主动告知医生用药史。