功能性消化不良一般可以治愈，但具体治疗效果因人而异，需结合病情严重程度、治疗依从性等因素综合判断。多数患者通过规范治疗和生活方式调整可有效缓解症状，甚至达到临床治愈。
功能性消化不良的发生与胃肠动力异常、内脏高敏感等因素有关。若患者存在幽门螺杆菌感染，根除治疗后部分患者症状可明显改善。对于胃肠动力不足者，遵医嘱使用多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利片等促胃动力药物有助于缓解腹胀。若伴随胃酸分泌过多，奥美拉唑肠溶胶囊、雷贝拉唑钠肠溶片等抑酸药可减轻反酸、烧心等症状。
日常需注意规律饮食，避免暴饮暴食或过度节食，减少辛辣、油腻食物的摄入。保持情绪稳定有助于改善胃肠功能紊乱，必要时可进行心理疏导。若症状反复或加重，建议及时复诊调整治疗方案，避免自行长期服用药物掩盖病情。