溶菌酶含片作为口腔咽喉部感染的辅助治疗药物，其副作用主要包括过敏反应、胃肠道不适以及口腔局部刺激等。若用药后出现异常症状，建议及时停药并就医处理。
溶菌酶含片可能引起过敏反应，尤其对鸡蛋过敏者风险较高。服用后可能出现皮疹、皮肤瘙痒、喉头水肿等症状，严重时可导致过敏性休克。此外，部分患者服药后可能出现恶心、胃部烧灼感等消化道症状，通常与药物刺激胃黏膜有关。长期或过量使用可能引发口腔黏膜干燥、味觉异常等局部刺激反应，少数情况下可能干扰口腔正常菌群平衡。
用药期间需避免同时服用其他含酶类药物，以免加重不良反应。儿童、孕妇及哺乳期女性应在医师指导下使用，过敏体质者慎用。若用药3天后症状未缓解或出现呼吸困难等严重反应，应立即停止使用并就诊。