菩提根发霉可能对身体有害，具体需根据接触方式及发霉程度判断。若作为文玩长期接触发霉的菩提根，或误食发霉的菩提根，均可能引发健康问题。
菩提根表面发霉后可能滋生霉菌，其孢子飘散在空气中可能诱发过敏反应，如打喷嚏、眼睛发痒或皮肤红肿等。对于免疫力较低的人群，吸入霉菌孢子还可能增加呼吸道感染风险。若菩提根被当作食物误食，霉菌产生的毒素可能刺激胃肠道，引起腹痛、腹泻、呕吐等消化道症状，严重时甚至可能损伤肝脏功能。
建议发现菩提根发霉后及时处理，可用软布擦拭霉斑并置于通风处晾晒。日常保存时注意保持环境干燥，避免存放在潮湿区域。若因接触发霉菩提根出现持续不适症状，应及时到正规医疗机构就诊检查。