明太鱼作为常见的深海鱼类，其食用安全性需要根据具体情况判断。通常情况下，合理处理并适量食用不会对健康造成危害，但部分人群或特殊情况下可能存在一定风险。
明太鱼的鱼皮和内脏可能携带异尖线虫等寄生虫，未经充分加热处理直接食用可能引发寄生虫感染。深海鱼类普遍存在重金属富集现象，体型较大的明太鱼体内可能蓄积汞等重金属物质，长期过量摄入可能影响神经系统健康。部分过敏体质人群食用后可能出现皮肤瘙痒、呼吸困难等过敏反应，这与鱼类蛋白中的特定致敏原有关。
建议通过正规渠道购买具有检验检疫证明的产品，烹饪时确保中心温度达到75℃并持续1分钟以上。孕妇、儿童及肝肾功能不全者应控制摄入量，每周食用深海鱼不超过200克为宜。出现异常症状应及时就医，由专业医生进行诊断处理。