外斐氏试验阴性时，需考虑其他病原体感染、非感染性疾病以及试验方法的局限性等因素。该试验主要用于辅助诊断立克次体感染，但阴性结果不能完全排除疾病，需结合临床表现和其他检查综合分析。
1、其他病原体感染
部分感染性疾病可能出现类似立克次体感染的症状，如发热、皮疹等。例如病毒感染（如登革热、流行性出血热）、细菌感染（如伤寒、副伤寒）或螺旋体感染（如钩端螺旋体病）。此时可通过血培养、血清特异性抗体检测或分子生物学检测（如PCR）进一步鉴别病原体。
2、非感染性疾病
某些自身免疫性疾病（如系统性红斑狼疮）、药物热或恶性肿瘤也可能出现持续发热、皮疹等表现。例如药物热常伴有用药史，停药后体温可下降；结缔组织病可通过抗核抗体谱、补体检测等实验室指标协助诊断。
3、试验方法局限性
外斐氏试验存在假阴性可能，如检测时间过早（抗体未达到可检测水平）、免疫功能低下导致抗体生成不足，或立克次体菌株变异导致抗原不匹配。建议在病程2-4周后复查，并行微量免疫荧光试验等更敏感的方法复核。
出现疑似立克次体感染症状但外斐氏试验阴性时，应及时完善血常规、C反应蛋白、影像学检查及病原体基因检测。治疗需根据最终诊断决定，细菌感染可使用头孢曲松钠、多西环素片等抗生素，病毒感染则以对症治疗为主。所有用药均需在医生指导下进行，避免自行服药延误病情。