次氯酸钠可以作为消毒剂使用，其消毒效果与浓度、作用时间等因素有关，需根据具体用途合理配制。次氯酸钠水解生成的次氯酸具有强氧化性，能够破坏微生物的细胞结构，从而达到杀菌消毒的目的。
次氯酸钠常用于医疗机构、公共场所和家庭环境的物体表面消毒。对于一般物体表面，可将有效氯浓度稀释至250-500mg/L，作用时间不少于10分钟；若用于污染明显的物品，建议将浓度提升至1000-2000mg/L。该消毒剂对细菌繁殖体、病毒和真菌孢子均有杀灭效果，但对结核杆菌和细菌芽孢需延长作用时间或提高浓度。
使用时需注意配制浓度不宜过高，过高浓度不仅刺激性强，还可能腐蚀金属制品。禁止与洁厕灵等酸性清洁剂混合使用，避免产生有毒氯气。日常保存应置于阴凉避光处，开封后建议一个月内用完。进行消毒操作时应佩戴橡胶手套，保持环境通风，消毒后用清水擦拭残留。