四价和九价HPV疫苗的主要区别在于预防的HPV型别范围、适用年龄以及接种程序等方面。九价疫苗覆盖的病毒型别更广，能够预防更多的高危型HPV感染。
1、预防范围
四价HPV疫苗可以预防HPV6、11、16、18四种型别，其中HPV16、18属于高危致癌型，而HPV6、11是导致生殖器疣的主要型别。九价疫苗在四价基础上新增了对HPV31、33、45、52、58五种高危型别的预防，能预防约90%的宫颈癌及相关癌前病变。
2、适用年龄
四价疫苗适用于9-45岁女性及男性，而九价疫苗在国内获批的接种年龄为9-45岁女性。虽然部分国家批准了男性接种，但国内目前尚未开放男性接种九价疫苗的许可。
3、接种程序
两种疫苗均需接种三剂次。四价疫苗推荐在0、2、6月各接种一针，第二针与首针间隔至少1个月，第三针与第二针间隔至少3个月。九价疫苗可采用0、2、6月的标准接种程序，在特定情况下允许更灵活的接种时间安排，但所有剂次应在1年内完成。
目前两种疫苗均不能覆盖所有高危HPV型别，接种后仍需定期进行宫颈癌筛查。选择疫苗时需结合年龄限制、可及性、经济条件等因素，建议在接种前咨询专业医疗人员，根据个体情况选择适宜的疫苗类型。适龄女性越早接种预防效果越好，无论选择哪种疫苗都能有效降低HPV相关疾病风险。