肛指检查通常包括体位准备、消毒、检查操作和观察等步骤，需由专业医生进行操作。检查时患者需配合医生摆好体位，并尽量放松以减轻不适感。
1、体位准备
患者通常采取膝胸卧位或侧卧位，侧卧位时需双腿屈曲贴近腹部。医生会指导患者调整姿势以便充分暴露肛门区域，同时使用一次性床垫保持清洁。部分情况下可能采用截石位，适用于行动不便或老年患者。
2、消毒与润滑
医生会佩戴无菌手套并进行手部消毒，在食指指腹涂抹适量医用石蜡油等润滑剂。使用前需确认患者无润滑剂过敏史，同时对肛周皮肤进行初步观察和消毒处理，防止交叉感染。
3、检查操作
检查者将食指指腹轻贴肛门口，待括约肌松弛后缓慢旋入直肠。进入深度约5-7厘米时会进行环形触诊，重点检查前列腺（男性）、子宫颈（女性）及直肠壁情况。触诊时会注意黏膜光滑度、有无肿块及触痛区域，必要时会进行前列腺按摩。
4、退出观察
检查完毕时缓慢退出手指，观察指套有无血迹、黏液或异常分泌物。发现异常时会留取标本送检，退出过程中再次评估肛门括约肌张力，特别注意有无痔核脱出或肛裂情况。
检查后医生会告知患者初步结果，发现异常可能建议进一步做肠镜或影像学检查。检查过程中如有明显疼痛需立即告知医生，术后可正常活动，但建议检查后24小时内避免剧烈运动。存在严重肛裂或急性感染的患者需提前告知医生，必要时改期检查。