中药牡蛎具有平肝潜阳、镇静安神、软坚散结、收敛固涩以及制酸止痛等功效和作用。其临床应用需根据具体证型，在中医师辨证指导下进行。
1、平肝潜阳
牡蛎质重沉降，能抑制上亢的肝阳，适用于肝阳上亢引起的头痛眩晕、耳鸣目赤等症状，常与龙骨、代赭石等配伍使用。现代研究显示其含有的碳酸钙成分可能对调节神经兴奋性有辅助作用。
2、镇静安神
煅制后的牡蛎镇静效果增强，可改善心悸失眠、惊痫癫狂等心神不宁症状，多与酸枣仁、茯苓等安神药物联合应用。其含有的多种微量元素可能通过调节神经递质发挥作用。
3、软坚散结
生牡蛎具有消散结块的功效，适用于痰火郁结所致的瘰疬痰核、甲状腺结节等病症，常配伍玄参、贝母等药物。其咸味特性在中医理论中被认为具有软化坚硬组织的特性。
4、收敛固涩
煅牡蛎固涩作用显著，可治疗自汗盗汗、遗精滑精、崩漏带下等滑脱证候。其吸湿收敛的物理特性可减少体表及黏膜的异常分泌，常与麻黄根、五味子同用。
5、制酸止痛
针对胃酸过多引起的胃脘疼痛，煅牡蛎能中和胃酸，缓解反酸烧心等症状，多与海螵蛸、瓦楞子等配伍。其碱性成分可有效降低胃内酸度，保护胃黏膜。
使用牡蛎时需注意，脾胃虚寒者应慎用生品，表虚多汗者不宜单独使用。建议在专业中医师指导下，根据具体体质和病情进行药物配伍，避免自行用药。煎煮时应先打碎以增加有效成分溶出，常规用量为9-30克，特殊病症可酌情增量。