小孩阴茎短小可能与生理性因素或病理性因素有关，通常可通过观察等待、调整生活习惯、药物治疗、手术治疗等方式处理。若存在隐匿性阴茎、小阴茎症等疾病，需根据具体原因遵医嘱干预。
1、生理性因素
部分儿童因肥胖导致阴茎被皮下脂肪包裹，表现为阴茎短小。这种情况一般无需特殊治疗，需控制体重、适当增加运动，并注意外阴清洁。随着脂肪减少，阴茎外观可逐渐改善。
2、隐匿性阴茎
由于阴茎皮肤发育异常或耻骨前脂肪堆积，导致阴茎体部分或全部埋藏于皮下。轻度可通过牵拉阴茎等保守治疗改善，中重度需行阴茎成形术或脂肪抽吸术，帮助阴茎体外露。
3、小阴茎症
阴茎长度小于同龄儿童平均值2.5个标准差时，需考虑先天性激素分泌异常或染色体疾病。可通过局部涂抹睾酮凝胶促进阴茎发育，存在生长激素缺乏者可注射重组人生长激素，但需在儿童内分泌科医生指导下规范使用。
发现阴茎短小时应尽早就诊小儿泌尿外科或内分泌科，通过激素检测、染色体分析等明确病因。治疗期间避免自行使用偏方或激素类药物，定期复查评估发育情况。若需手术治疗，建议选择儿童专科医院，术后需做好伤口护理及随访。