二妙丸和四妙丸的区别主要在于药物组成、功效侧重以及适应症不同，两者均为祛湿类中成药，但需根据具体病情遵医嘱选择。二妙丸由苍术、黄柏组成，四妙丸在此基础上增加牛膝、薏苡仁。
1、成分不同
二妙丸的基础方为苍术与黄柏配伍，其中苍术可燥湿健脾，黄柏能清热燥湿。四妙丸则在二妙丸组方中新增牛膝和薏苡仁，牛膝可补肝肾、强筋骨，薏苡仁具有利水渗湿、健脾止泻的功效。成分的差异直接影响了两者的作用范围。
2、功效侧重不同
二妙丸侧重于清热燥湿，主要用于湿热下注引起的足膝红肿热痛、下肢丹毒、阴囊潮湿等症。四妙丸因加入牛膝和薏苡仁，在清热利湿的基础上增强了下焦湿热的清除能力，同时具备通利关节的作用，更适用于湿热下注导致的筋骨疼痛、腰膝酸软。
3、适应症不同
二妙丸常用于湿疹、足癣、白带异常等湿热局限于下肢的病症。四妙丸的适应症更广泛，对湿热型痛风性关节炎、膝关节滑膜炎、泌尿系统感染等疾病有更好的疗效，尤其适合伴随关节肿胀、活动受限的患者。
用药前需经中医师辨证，湿热证患者需忌食辛辣油腻。若服药后出现腹泻等不适，应减量或停用。两种药物均不宜长期服用，症状缓解后需调整治疗方案。