真菌检查的方法通常包括直接镜检、真菌培养、组织病理检查、血清学检测以及分子生物学检测等，具体需根据病情选择合适的方法。
1、直接镜检
直接镜检是快速筛查真菌感染的常用方法，通过采集皮屑、甲屑或分泌物等样本，使用氢氧化钾处理后置于显微镜下观察。该方法可在数分钟内发现菌丝或孢子，适用于浅部真菌感染的初步诊断，但无法区分具体菌种，可能存在假阴性结果。
2、真菌培养
真菌培养是鉴定菌种的金标准，将样本接种于沙氏培养基中，在25-30℃环境下培养2-4周。该方法可明确真菌种类并指导用药，例如区分皮肤癣菌、念珠菌或曲霉菌，但耗时长且部分苛养菌可能难以培养，常用于深部或疑难真菌感染的确诊。
3、组织病理检查
对于疑似深部真菌感染或肉芽肿性疾病，需取病变组织进行病理学检查。切片经特殊染色（如PAS、六胺银染色）后，可在组织内观察到真菌结构，有助于诊断侵袭性曲霉病、隐球菌病等，常与培养法联合使用以提高检出率。
4、血清学检测
通过检测血液中真菌抗原或抗体辅助诊断系统性感染。例如隐球菌荚膜多糖抗原检测对隐球菌性脑膜炎的敏感性达90%以上，半乳甘露聚糖试验常用于曲霉感染的早期筛查，但需注意免疫功能低下者可能出现假阴性。
5、分子生物学检测
采用PCR、基因测序等技术检测真菌DNA，适用于传统方法难以鉴别的菌种或混合感染。该方法灵敏度高，2-3小时即可获得结果，可用于念珠菌血症、肺孢子菌肺炎的快速诊断，但成本较高且对实验室条件要求严格。
若怀疑真菌感染，建议尽早就诊皮肤科或感染科，医生会根据感染部位、严重程度选择检查方案。浅表感染通常首选镜检和培养，深部感染需结合病理和血清学检测。检查前避免使用抗真菌药物，取样部位24小时内勿用消毒剂或护肤品，以确保结果准确性。