黄连上清丸作为中成药，一般具有清热解毒、散风止痛等功效，主要用于治疗风热上攻或肺胃热盛引起的急性口腔炎、牙龈炎、结膜炎、中耳炎以及急性咽炎等疾病。
1、急性口腔炎
黄连上清丸中的黄连、黄芩等成分具有清热燥湿的作用，可缓解口腔黏膜红肿、溃疡等炎症反应，适用于心胃火盛引起的口腔炎。
2、牙龈炎
该药通过清泻胃火，能减轻牙龈肿痛、出血等症状，对于胃火上炎导致的牙龈炎症具有缓解效果。
3、结膜炎
药物中的薄荷、菊花等成分能疏散风热，可改善风热犯目引起的眼结膜充血、分泌物增多等结膜炎症表现。
4、中耳炎
对于肝胆湿热上蒸耳窍所致的中耳炎，该药可通过利湿清热减轻耳道胀痛、渗液等中耳炎症状。
5、急性咽炎
方中连翘、桔梗等药物组合能清肺利咽，可缓解咽喉肿痛、吞咽困难等急性咽喉部炎症反应。
使用黄连上清丸需注意脾胃虚寒者慎用，服药期间忌食辛辣油腻食物。建议在中医师指导下根据具体证型使用，若服药3天症状未缓解或出现腹泻等不良反应应及时停用并就诊。