肠胃功能紊乱一般建议挂消化内科、普通内科或中医科，具体需根据症状表现及医院分科情况选择。若伴随其他系统症状或病因不明确，也可能需要转诊至其他科室进一步检查。
1、消化内科
消化内科是处理胃肠道疾病的主要科室，适合大多数肠胃功能紊乱患者。若出现腹痛、腹胀、腹泻、便秘、反酸等典型消化系统症状，建议首选消化内科就诊。医生可通过胃镜、肠镜、幽门螺杆菌检测等手段明确是否存在胃炎、肠易激综合征等疾病，并给予针对性治疗。
2、普通内科
当肠胃不适症状较轻或伴随发热、乏力等全身症状时，可先至普通内科就诊。该科室医生能进行初步鉴别诊断，排除感冒、电解质紊乱等全身性疾病引起的肠胃症状。若检查发现需专科处理，会及时转诊至消化内科或其他相关科室。
3、中医科
对于慢性肠胃功能紊乱或反复发作的功能性胃肠病患者，中医科可通过中药调理、针灸等方式改善脾胃功能。这类治疗尤其适合伴有体质虚弱、食欲不振、大便不调等症状，且西药治疗效果不佳的患者。
建议就诊前观察自身症状特点，如疼痛部位、发作频率、伴随症状等，便于准确描述病情。若出现呕血、便血、剧烈腹痛或体重明显下降等危险信号，应立即前往急诊科就诊。部分医院开设胃肠专科门诊或心身医学科，也可根据具体症状选择。