CT和磁共振检查在成像原理、适用部位及检查禁忌等方面存在差异，通常需根据病情需要选择。两者主要区别包括成像原理不同、适用部位不同、检查时间不同、禁忌证不同以及辐射暴露不同。
1、成像原理不同
CT检查利用X线穿透人体组织后形成的密度差异进行断层成像，而磁共振通过磁场激发氢原子产生信号，再经计算机处理生成图像。因此，磁共振对软组织分辨率更高，而CT对骨骼、肺部等结构显示更清晰。
2、适用部位不同
CT常用于检查骨折、肺部结节、脑出血及急诊外伤等；磁共振更适用于脑组织、脊髓、关节软骨、韧带及腹部器官的病变检测，例如脑梗死早期、半月板损伤等。
3、检查时间不同
CT扫描速度快，完成全身检查仅需数分钟，适合急诊患者；磁共振单部位检查通常需要15-30分钟，全程需保持静止，对于儿童或无法配合的患者可能需使用镇静剂。
4、禁忌证不同
磁共振严禁体内有心脏起搏器、金属植入物或幽闭恐惧症患者使用；CT检查主要禁忌为妊娠期女性（尤其孕早期），但必要时可在腹部防护下进行。此外，磁共振检查无电离辐射，而CT存在低剂量辐射暴露。
进行影像学检查前需去除金属物品，并如实告知医生病史及体内植入物情况。具体选择何种检查方式，应由临床医生根据症状、疑似疾病类型及患者个体情况综合判断。