细菌感染和病毒感染的致病微生物、症状特点、诊断方法以及治疗药物等方面均存在差异。细菌由完整的细胞结构组成，而病毒仅由核酸和蛋白质外壳构成；细菌感染常引起局部红肿热痛，病毒感染多伴随全身症状；诊断时需结合实验室检查；治疗药物需遵医嘱选择。
1、致病微生物
细菌是具有细胞壁、细胞膜等完整结构的单细胞微生物，能够独立存活并繁殖，常见如链球菌、大肠杆菌。病毒不具备细胞结构，必须依赖宿主细胞才能复制，如流感病毒、鼻病毒。两者结构差异导致对抗菌药物的敏感性不同。
2、症状特点
细菌感染多表现为局部化脓性炎症反应，如疖肿有脓液渗出，肺炎伴随黄痰，尿路感染出现尿频尿急。病毒感染常引起全身性症状，如流感会出现高热、肌肉酸痛，麻疹有特征性皮疹，病毒性肠炎多伴随水样腹泻。
3、诊断方法
血常规检查中，细菌感染通常白细胞和中性粒细胞明显升高，C反应蛋白、降钙素原等炎症指标上升。病毒感染常见淋巴细胞比例增高，病毒抗原检测或核酸检测可确诊。细菌培养和药敏试验是细菌感染诊断的金标准。
4、治疗药物
细菌感染需根据药敏结果选用抗生素，如头孢克肟片治疗呼吸道感染，阿莫西林胶囊用于中耳炎，左氧氟沙星滴眼液治疗结膜炎。病毒感染主要使用抗病毒药物，如奥司他韦胶囊针对流感，更昔洛韦治疗巨细胞病毒感染，同时需注意对症支持治疗。
当出现发热、咳嗽等症状时，建议及时进行血常规、病原学检测等检查。确诊前不宜自行使用抗生素，需在医生指导下规范用药。两种感染的治疗方案差异较大，准确鉴别对预后至关重要，延误诊治可能导致病情加重。