阴茎尺寸过大导致疼痛可能与生理性原因有关，也可能是阴茎异常勃起症、包皮系带过短、阴茎硬结症等疾病因素引起的。若症状持续或加重，建议及时就医明确病因。
1、生理性原因
阴茎尺寸过大者在勃起时可能因局部充血过度或性生活动作过于剧烈，导致阴茎海绵体及周围组织受到牵拉或摩擦，从而出现疼痛感。此类情况通常在适当休息、调整性生活频率或姿势后即可缓解，一般不需要特殊治疗。
2、阴茎异常勃起症
该病可能与血液回流受阻或药物因素相关，表现为勃起时间超过4小时且伴随疼痛。持续勃起会导致海绵体组织缺血缺氧，加重疼痛和肿胀。患者需尽早就医，医生可能采取冰敷、穿刺抽血或使用间羟胺等药物进行干预，必要时需进行分流手术。
3、包皮系带过短
先天性包皮系带过短者在阴茎勃起时，系带可能因过度牵拉而出现撕裂样疼痛，严重时可伴随出血。确诊后可通过包皮系带成形术或延长术改善症状，术后需遵医嘱使用头孢克肟片、阿莫西林胶囊等抗生素预防感染。
4、阴茎硬结症
又称佩罗尼氏病，与阴茎白膜纤维化有关，勃起时因硬结牵拉导致阴茎弯曲和疼痛。患者可遵医嘱使用维生素E软胶囊延缓病情进展，疼痛明显时可用双氯芬酸钠缓释片缓解，必要时需手术切除硬结。
日常需避免频繁刺激阴茎，选择宽松透气的内裤减少摩擦。若疼痛反复出现或伴随红肿、排尿异常等症状，应及时到泌尿外科就诊，通过超声检查、血液分析等明确诊断，避免自行服用止痛药掩盖病情。