衣原体和支原体是两种不同的微生物，主要区别包括细胞结构、生活习性以及所致疾病等方面。虽然两者均可引发感染，但生物学特性和临床表现存在差异。
1、细胞结构
衣原体具有细胞壁，其成分包括肽聚糖等，因此对某些抗生素较为敏感。支原体则缺乏细胞壁结构，仅由细胞膜包裹，这一特点使其对作用于细胞壁的抗生素（如青霉素）天然耐药。
2、生活习性
衣原体为专性细胞内寄生微生物，需要在宿主细胞内完成生命周期，无法自主合成能量物质。支原体虽然也能寄生于宿主细胞，但具备部分自主代谢能力，可在细胞外环境中生长繁殖，例如在人工培养基中进行培养。
3、所致疾病
衣原体感染常见沙眼、泌尿生殖系统感染（如非淋菌性尿道炎）以及呼吸道疾病（如鹦鹉热）。支原体感染则以肺炎支原体引起的呼吸道症状和生殖支原体导致的尿道炎较为典型。治疗方面，衣原体感染多采用阿奇霉素、多西环素等药物，支原体感染则可能选择克拉霉素或左氧氟沙星。
若出现发热、咳嗽、尿痛等疑似感染症状，建议及时进行病原学检测以明确诊断。临床用药需严格遵循医生指导，避免盲目使用抗生素导致耐药性产生。日常注意个人卫生和防护，可降低两类微生物的感染风险。